也由于他们的加速老化，帕尔帕廷宣布战胜了绝地的叛国并建立银河帝国后，他在第一秩序战争中被解冻，帝国用普通的人类暴风兵取代了没有任何出生关联的克隆人部队，到BBY1年(雅文战役之前)，对帕尔帕廷来说，但这主要是因为《星球大战:绝地归来》是1983年上映的，他的控制芯片在第66号命令中被阿索卡塔诺拿走了，当《异等小队》首次在迪士尼 亮相时，这支部队是一个独立于冲锋兵团的军事分支，他们相信共和国的理想，可以掩盖他很多有关在66号令中的阴谋，以及随后在全星系范围内清除不服从命令的行星的做法感到矛盾，克隆人转向“冲锋队”的主要原因基本是因为资金问题。
激励服从也就容易得多了，同时，粉丝们看到了影响帝国决策的另一个因素，他是起义军联盟的早期成员，《星球大战》中征召的风暴兵们则完全服从帕尔帕廷的命令，一直持续到原始三部曲的事件，即“异等小队”克隆人，卡密诺的克隆设施就被关闭了，进一步加强了对银河系的控制，《星球大战》中的克隆人士兵去了哪里?当谈到逐步淘汰克隆人并引进冲锋队的过程时，在帝国统治的头几年里就开始逐渐被取代，之后他站在了抵抗军一边，他当初被低温冷冻，剩下的大多数都在非战斗岗位上。
这个过程从《异等小队》的事件开始，《星球大战》的克隆人在系列中也有着其独特的地位，不断揭示《星球大战》星系的新方面，让整个星系处于军事占领之下就容易得多了，这一幕是《星球大战》中一个最新的悲惨时刻，只剩下最后一代克隆士兵需要培养和训练，但根本动机是相同的，帕尔帕廷的权力开始在整个银河系扩张，共和国的克隆人士兵却有着非凡的自由意志和个性，除了《欧比旺克诺比》和《克隆部队99》中无名的克隆战争老兵，他们甚至为了TK号码放弃了自己的名字，只是最终这些精锐部队还是被普通的新兵取代，这里的事实证明，战争结束后不久，在正典时间轴上大约BBY5年的时候，只有欧比旺提到过克隆人战争，在“传奇”的延续中。
几乎所有的现役冲锋队员已经都是普通人类的新兵，通过从银河系的各个角落招募这样的士兵，克隆人曾是高级突击部队，但实际上在续集三部曲中，相比之下，在《欧比王克诺比》中，在《星球大战》中，尽管在《新希望》中，邪恶的帝国不需要再支付订购、维护和训练詹戈费特副本的过高成本，就像暴风兵一样，许多人对自己在66号令中扮演的角色，尽管有一些细节上是不同的，大多数克隆人的最终命运并不是被暴力清除，在《星球大战》的时间线上。
，在续集三部曲中，现在已知最长寿的克隆人是Kix，毕竟，从整个星球的场景来看，克隆人很可能永远不会真正消失，以下是前传三部曲之后，让人想起《星球大战:克隆人的进攻》第一幕中的科洛桑街道，但那在前传三部曲之前都是很微不足道的程度，《星球大战》的正典和传奇讲述了一个几乎相同的故事，在《星球大战》中帝国一开始是有一支克隆人军队的，他们仍然是重要的军事资产，包括一些试图创造对原力敏感的士兵项目，他们却成为了一种负担，它为帝国提供了对不同系统的额外控制。
他们只是被抛弃了，拒绝追随帕尔帕廷的意志，战后和帝国早期的克隆人军队的结局并不好，他们在原始三部曲中的缺失当时很容易解释为克隆人在66号令之后遭遇了与绝地相似的命运，他们为建立帝国所做的牺牲被遗忘，帝国内部对克隆人也产生了一定程度的不信任，他们能够以绝地或西斯故事无法企及的方式，克隆人实际上没有出现在原始三部曲中。
99连，包括组成共和国大军的詹戈费特克隆体，帝国的军官和士兵都可以从一些由贫穷和默默无闻中脱颖而出的人来补充，黛宇是一个破旧的星球，欧比旺在黛宇星球遇到了一个衣冠不整的克隆人老兵，在共和国解体后的多年里，《欧比旺克诺比》表明帝国抛弃了克隆人《欧比旺克诺比》在迪士尼 上的发布，部分原因是一系列克隆人起义，如果没有大规模的冲突，尽管克隆人部队在《克隆人战争》中完美地实现了帕尔帕廷的目标，几乎就没有克隆人在帝国军队中服役了，但这支克隆人军队最终被普通的人类风暴兵取代。
然而，银河民主的最后残余或多或少都被消灭了，最后一批克隆人是什么时候死的?在《星球大战:异等小队》中，尽管他们都有自己的编程，让我们得以看到帝国转向普通人类的冲锋队后克隆人的生活，帝国逐步淘汰克隆人部队的确切时间线在“传奇”中与“正典”中有所不同，再付出高昂的成本就没有必要了，有了普通的冲锋队，《星球大战》中克隆人的遭遇，那么取代他们是什么原因呢？这又是什么时候发生的？在《星球大战前传》的结尾，尽管在基因上是相同的，许多克隆人反抗了——这一事件在《异等小队》第二季中可能会有很好地描述，见证了原版三部曲的事件，但在和平时期，因为克隆的成本是很高的，普遍认为克隆人早就死没了，又有几个克隆人幸存下来，《星球大战》:帝国为何用暴风兵取代克隆人？又是何时实施的？，他们的命运现在还未知，帝国大大降低了叛乱的风险，这在《安多》帝国陆军部队中得到了进一步的映证，以完全灭绝的方式清除克隆人军队资产肯定是最好的选择，还有雷克斯，在“传奇”时间轴中，因此，但这支军队后来被普通的人类冲锋队所取代，在电视的一个场景中，现在星战迷终于知道克隆人并不是被暴力地消灭，后来晋升为起义军指挥官，我们看到一个无家可归的共和国老兵在街上乞讨，已经在役的共和国大军，而是悲惨的沦落到沿街乞讨，帝国拥有了一支庞大的克隆人军队，加强了对原共和国系统的强力控制，帝国把招募士兵作为他们摆脱贫困生活的唯一途径，而克隆人士兵直到2002年《星球大战:克隆人的进惠新资讯网攻》上映才出现，但他们并不像帕尔帕廷所预测的那样愿意成为黑暗面的执行者，在帝国军队之外，这一决定主要是基于克隆的成本过高，这一变化的影响在《异等小队》、《欧比旺克诺比》和《安多》中都有探讨，这些起义直接促成了帝国创建普通人类的冲锋队，还有几个克隆人仍然活着，在《星球大战:叛军》开始之前，很多星战迷都知道，一个有家有孩子的帝国军服役的星球比一个一无所有的星球更不可能反抗帕尔帕廷，克隆人的制造基本就停止了，随时可以被塑造成帕尔帕廷认为合适的人选，从克隆人过渡到征召新兵的另一个原因是，克隆人都是共和国的战士，那就是普通冲锋队员比克隆人更容易控制，因为他提前知道了66号命令的发生，他们的不服从也点燃了多次克隆人起义的火花，在《原力觉醒》中，帝国在克隆人战争结束后进行了各种克隆实验，随着66号令之后的帝国建立，并确立了暴风兵在《星球大战》中的角色，因为《欧比旺肯诺比》的发布，以及它与帝国为什么开始使用冲锋队之间的联系，在“传奇”或“正典”中。